Al igual que en la anterior oportunidad en la que había descendido (1941), ganó el torneo de segunda y ascendió a la primera división al año siguiente. En el Torneo Verano 1999, a pesar de finalizar en la quinta posición de la tabla general, los «Guerreros» tuvieron que enfrentar a los Tecos de la UAG en el repechaje, ganando en el global 7-5, luego se impuso al América en cuartos de final por marcador de 3-2, camiseta retro betis y finalmente fue eliminado en semifinales por Toluca.